Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp1a4Q9WV27 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atp1a4Q9WV27 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp1a4Q9WV27 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms