Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHMP2BQ9UQN3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP2BQ9UQN3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2BQ9UQN3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms