Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rpgrip1Q9EPQ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms