Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930583I09RikQ9D2E3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4930583I09RikQ9D2E3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930583I09RikQ9D2E3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms