Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY50

Ssr1, Translocon-associated protein subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr1Q9CY50 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ssr1Q9CY50 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ssr1Q9CY50 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ssr1Q9CY50 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms