Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Exo5Q9CXP9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Exo5Q9CXP9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Exo5Q9CXP9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Exo5Q9CXP9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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