Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sgo1Q9CXH7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sgo1Q9CXH7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19■□□□□ 0.63
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Sgo1Q9CXH7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Sgo1Q9CXH7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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