Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Depp1Q8K2F3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Depp1Q8K2F3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms