Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIF6

Sidt2, SID1 transmembrane family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sidt2Q8CIF6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sidt2Q8CIF6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sidt2Q8CIF6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sidt2Q8CIF6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sidt2Q8CIF6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sidt2Q8CIF6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sidt2Q8CIF6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sidt2Q8CIF6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sidt2Q8CIF6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sidt2Q8CIF6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sidt2Q8CIF6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms