Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3Q9

Casp9, Caspase-9, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp9Q8C3Q9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp9Q8C3Q9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp9Q8C3Q9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp9Q8C3Q9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp9Q8C3Q9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casp9Q8C3Q9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp9Q8C3Q9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp9Q8C3Q9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp9Q8C3Q9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp9Q8C3Q9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp9Q8C3Q9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp9Q8C3Q9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp9Q8C3Q9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp9Q8C3Q9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp9Q8C3Q9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp9Q8C3Q9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp9Q8C3Q9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms