Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIE5

Atp1a2, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a2Q6PIE5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a2Q6PIE5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a2Q6PIE5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp1a2Q6PIE5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a2Q6PIE5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a2Q6PIE5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp1a2Q6PIE5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a2Q6PIE5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a2Q6PIE5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a2Q6PIE5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a2Q6PIE5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a2Q6PIE5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a2Q6PIE5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atp1a2Q6PIE5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp1a2Q6PIE5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp1a2Q6PIE5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp1a2Q6PIE5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms