Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HjurpQ6PG16 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HjurpQ6PG16 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HjurpQ6PG16 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms