Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,05■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21,04■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC21,04■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC21,03■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC21,03■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC21,02■□□□□ 0,96
Prm3Q62100 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,02■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC20,98■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC20,98■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20,98■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20,97■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC20,97■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Prm3Q62100 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC20,94■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20,93■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20,92■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20,91■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Prm3Q62100 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,5 ms