Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne9Q1RLL3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne9Q1RLL3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpne9Q1RLL3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne9Q1RLL3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne9Q1RLL3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne9Q1RLL3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne9Q1RLL3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne9Q1RLL3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne9Q1RLL3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne9Q1RLL3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cpne9Q1RLL3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpne9Q1RLL3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpne9Q1RLL3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpne9Q1RLL3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpne9Q1RLL3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cpne9Q1RLL3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne9Q1RLL3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cpne9Q1RLL3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne9Q1RLL3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms