Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 PTC3YBL056W 1407 nt6.05□□□□□ -1.44
RPN6Q12377 YGR127WYGR127W 939 nt6.04□□□□□ -1.44
RPN6Q12377 COA1YIL157C 594 nt6.04□□□□□ -1.44
RPN6Q12377 POP5YAL033W 522 nt6.04□□□□□ -1.44
RPN6Q12377 RPL21AYBR191W 483 nt6.04□□□□□ -1.44
RPN6Q12377 ILV6YCL009C 930 nt6.04□□□□□ -1.44
RPN6Q12377 RGD1YBR260C 2001 nt6.04□□□□□ -1.44
RPN6Q12377 ACS1YAL054C 2142 nt6.04□□□□□ -1.44
RPN6Q12377 YDR278CYDR278C 318 nt6.03□□□□□ -1.44
RPN6Q12377 YML6YML025C 861 nt6.03□□□□□ -1.44
RPN6Q12377 EFT2YDR385W 2529 nt6.03□□□□□ -1.44
RPN6Q12377 EFT1YOR133W 2529 nt6.03□□□□□ -1.44
RPN6Q12377 CSC1YLR241W 2349 nt6.03□□□□□ -1.44
RPN6Q12377 AMD2YDR242W 1650 nt6.02□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 snR82snR82 268 nt6.02□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 FPR3YML074C 1236 nt6.02□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 SGF29YCL010C 780 nt6.02□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 GPI11YDR302W 660 nt6.01□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 TMT1YER175C 900 nt6.01□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 HRQ1YDR291W 3234 nt6.01□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 PFK2YMR205C 2880 nt6□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 LAG2YOL025W 1983 nt6□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 COX9YDL067C 180 nt6□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 YBR027CYBR027C 333 nt6□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 YMC1YPR058W 924 nt6□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 UIP5YKR044W 1332 nt5.99□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 PYC2YBR218C 3543 nt5.99□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 SGV1YPR161C 1974 nt5.99□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 RBS1YDL189W 1374 nt5.99□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 BUG1YDL099W 1026 nt5.99□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 THI4YGR144W 981 nt5.99□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 MPA43YNL249C 1629 nt5.99□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 RSA4YCR072C 1548 nt5.99□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 ZWF1YNL241C 1518 nt5.99□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 EXG1YLR300W 1347 nt5.99□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 PXL1YKR090W 2121 nt5.98□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.98□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 YIR042CYIR042C 711 nt5.98□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 YJR084WYJR084W 1272 nt5.98□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 OAC1YKL120W 975 nt5.98□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 RPS3YNL178W 723 nt5.98□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 YMR279CYMR279C 1623 nt5.98□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 ATG22YCL038C 1587 nt5.97□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 RIX7YLL034C 2514 nt5.97□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 YDR514CYDR514C 1452 nt5.97□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 IMG1YCR046C 510 nt5.97□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 ALT2YDR111C 1524 nt5.97□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 KEL1YHR158C 3495 nt5.97□□□□□ -1.45
RPN6Q12377 CUP2YGL166W 678 nt5.96□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 CCP1YKR066C 1086 nt5.96□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 ARA2YMR041C 1008 nt5.96□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 MCH1YDL054C 1461 nt5.96□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 RMD9YGL107C 1941 nt5.95□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 HIS7YBR248C 1659 nt5.95□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 RAD59YDL059C 717 nt5.95□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 ILV1YER086W 1731 nt5.95□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 YGL235WYGL235W 537 nt5.95□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 KTR5YNL029C 1569 nt5.95□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 LDB19YOR322C 2457 nt5.94□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 YTP1YNL237W 1380 nt5.94□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.94□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 GLC8YMR311C 690 nt5.94□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 DAP1YPL170W 459 nt5.94□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 YCK1YHR135C 1617 nt5.94□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 ESC8YOL017W 2145 nt5.93□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 VHT1YGR065C 1782 nt5.93□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 YDR187CYDR187C 519 nt5.93□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 ICT1YLR099C 1185 nt5.93□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 YHL017WYHL017W 1599 nt5.93□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 HXT17YNR072W 1695 nt5.92□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 PGK1YCR012W 1251 nt5.92□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 SDH4YDR178W 546 nt5.92□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 AAT2YLR027C 1257 nt5.92□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 YML083CYML083C 1257 nt5.92□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 YPR123CYPR123C 435 nt5.92□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 TAE1YBR261C 699 nt5.92□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 YOL036WYOL036W 2286 nt5.92□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 PRP24YMR268C 1335 nt5.92□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 AFG1YEL052W 1530 nt5.91□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt5.91□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 YMR252CYMR252C 405 nt5.91□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 YBL112CYBL112C 318 nt5.91□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 YOR111WYOR111W 699 nt5.91□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 YOR300WYOR300W 309 nt5.91□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 STB5YHR178W 2232 nt5.91□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 PET112YBL080C 1626 nt5.9□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 MPC2YHR162W 390 nt5.9□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 AIM20YIL158W 615 nt5.9□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 MRS1YIR021W 1092 nt5.9□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 YKL153WYKL153W 510 nt5.9□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 IDP3YNL009W 1263 nt5.9□□□□□ -1.46
RPN6Q12377 HAS1YMR290C 1518 nt5.89□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 PYK2YOR347C 1521 nt5.89□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 YDR387CYDR387C 1668 nt5.89□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.89□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 RPS28AYOR167C 204 nt5.89□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 RVB2YPL235W 1416 nt5.89□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 YPR196WYPR196W 1413 nt5.89□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 GUD1YDL238C 1470 nt5.89□□□□□ -1.47
RPN6Q12377 YLL067CYLL067C 3618 nt5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.7 ms