Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 SCS7YMR272C 1155 nt6.62□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 RNH201YNL072W 924 nt6.62□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 YHL018WYHL018W 363 nt6.61□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 MEH1YKR007W 555 nt6.61□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 SNU71YGR013W 1863 nt6.61□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 PRY3YJL078C 2646 nt6.61□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 ECM38YLR299W 1983 nt6.6□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 GYP8YFL027C 1494 nt6.6□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 BDF2YDL070W 1917 nt6.6□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 RVB2YPL235W 1416 nt6.6□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 ARP3YJR065C 1350 nt6.6□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 PMT3YOR321W 2262 nt6.6□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 HVG1YER039C 750 nt6.6□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 PSR2YLR019W 1194 nt6.6□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 YLR312CYLR312C 1197 nt6.6□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 DSF1YEL070W 1509 nt6.6□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 YNR073CYNR073C 1509 nt6.6□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 MPA43YNL249C 1629 nt6.59□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 RAD59YDL059C 717 nt6.59□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 RPP1YHR062C 882 nt6.59□□□□□ -1.35
VPS54Q12071 YDR387CYDR387C 1668 nt6.58□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 NSE5YML023C 1671 nt6.58□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 FHN1YGR131W 525 nt6.58□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 AIM24YJR080C 1185 nt6.58□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 YJR084WYJR084W 1272 nt6.58□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 SUR7YML052W 909 nt6.58□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 POX1YGL205W 2247 nt6.57□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 HSP12YFL014W 330 nt6.57□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 FZF1YGL254W 900 nt6.57□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 YLR123CYLR123C 330 nt6.57□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 YNL017CYNL017C 339 nt6.57□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 YBL070CYBL070C 321 nt6.57□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 YNL200CYNL200C 741 nt6.57□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 CDC16YKL022C 2523 nt6.57□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 AMD2YDR242W 1650 nt6.57□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 ERG1YGR175C 1491 nt6.56□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 BUG1YDL099W 1026 nt6.56□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 AAT2YLR027C 1257 nt6.56□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 UTR2YEL040W 1404 nt6.56□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 ATF1YOR377W 1578 nt6.56□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 PEX3YDR329C 1326 nt6.55□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.55□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt6.55□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 MKK1YOR231W 1527 nt6.55□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 HXT2YMR011W 1626 nt6.54□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 PHO3YBR092C 1404 nt6.54□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 RPS3YNL178W 723 nt6.54□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 YFR006WYFR006W 1608 nt6.54□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 AVT4YNL101W 2142 nt6.53□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 GDA1YEL042W 1557 nt6.53□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 YPR204WYPR204W 3099 nt6.53□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 TSR3YOR006C 942 nt6.53□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 RKI1YOR095C 777 nt6.53□□□□□ -1.36
VPS54Q12071 CRF1YDR223W 1404 nt6.52□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 QCR6YFR033C 444 nt6.52□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 RRP46YGR095C 672 nt6.52□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt6.52□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 COX5AYNL052W 462 nt6.52□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 COQ3YOL096C 939 nt6.52□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt6.51□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 PRE3YJL001W 648 nt6.51□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 AVO2YMR068W 1281 nt6.51□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 CEF1YMR213W 1773 nt6.51□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 KNS1YLL019C 2214 nt6.5□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 RIX7YLL034C 2514 nt6.5□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 SES1YDR023W 1389 nt6.5□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 LCB3YJL134W 1230 nt6.5□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 HRQ1YDR291W 3234 nt6.49□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 ECM14YHR132C 1293 nt6.49□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 QCR8YJL166W 285 nt6.49□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 KTR1YOR099W 1182 nt6.49□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 ILV1YER086W 1731 nt6.49□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 JIP4YDR475C 2631 nt6.49□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 BUD9YGR041W 1644 nt6.49□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 MAK31YCR020C-A 267 nt6.48□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 MED6YHR058C 888 nt6.48□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 DOT5YIL010W 648 nt6.48□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 MCH1YDL054C 1461 nt6.47□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 TMT1YER175C 900 nt6.47□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 MOG1YJR074W 657 nt6.47□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 ZRT2YLR130C 1269 nt6.47□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 QRI5YLR204W 336 nt6.47□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 IES2YNL215W 963 nt6.47□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 RPS28AYOR167C 204 nt6.47□□□□□ -1.37
VPS54Q12071 YET3YDL072C 612 nt6.46□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 YDL218WYDL218W 954 nt6.46□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 YDR015CYDR015C 240 nt6.46□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 ISC1YER019W 1434 nt6.46□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 YNL285WYNL285W 372 nt6.46□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 YLL067CYLL067C 3618 nt6.45□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 YUR1YJL139C 1287 nt6.45□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 POP5YAL033W 522 nt6.45□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 YMC1YPR058W 924 nt6.44□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 YIL055CYIL055C 1884 nt6.44□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 LYS21YDL131W 1323 nt6.44□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 EXG1YLR300W 1347 nt6.44□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 CHS5YLR330W 2016 nt6.43□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 ARG81YML099C 2643 nt6.43□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 YNL165WYNL165W 1221 nt6.43□□□□□ -1.38
VPS54Q12071 GAA1YLR088W 1845 nt6.43□□□□□ -1.38
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