Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBXN1Q04323 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBXN1Q04323 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBXN1Q04323 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms