Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rbp1Q00915 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rbp1Q00915 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbp1Q00915 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms