Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psmb4P99026 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Psmb4P99026 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psmb4P99026 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psmb4P99026 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms