Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nbr1P97432 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nbr1P97432 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nbr1P97432 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nbr1P97432 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms