Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Irx3P81067 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irx3P81067 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irx3P81067 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Irx3P81067 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Irx3P81067 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irx3P81067 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Irx3P81067 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Irx3P81067 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx3P81067 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Irx3P81067 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx3P81067 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Irx3P81067 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Irx3P81067 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Irx3P81067 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms