Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Igfbp3P47878 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Igfbp3P47878 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Igfbp3P47878 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Igfbp3P47878 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Igfbp3P47878 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Igfbp3P47878 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Igfbp3P47878 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Igfbp3P47878 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms