Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pax7P47239 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pax7P47239 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pax7P47239 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax7P47239 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax7P47239 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pax7P47239 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pax7P47239 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pax7P47239 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax7P47239 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pax7P47239 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms