Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 CEP72-202ENST00000499639 461 ntTSL 311.77□□□□□ -0.533e-12■■■■■ 44.4
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GTF2F1P35269 AEBP2-206ENST00000538425 518 ntAPPRIS ALT2 TSL 47.35□□□□□ -1.233e-12■■■■■ 44.1
GTF2F1P35269 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.793e-7■■■■■ 44
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GTF2F1P35269 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.161e-7■■■■■ 44
GTF2F1P35269 MTCH1-204ENST00000460219 1572 ntTSL 223.43■■□□□ 1.341e-7■■■■■ 44
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GTF2F1P35269 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.431e-10■■■■■ 43.9
GTF2F1P35269 PAXIP1-201ENST00000397192 3711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.641e-10■■■■■ 43.9
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GTF2F1P35269 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 43.9
GTF2F1P35269 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.533e-7■■■■■ 43.9
GTF2F1P35269 BPHL-206ENST00000430655 2157 ntTSL 1 (best)26.5■■□□□ 1.839e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.751e-6■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 BPHL-205ENST00000424847 1563 ntTSL 1 (best)25.36■■□□□ 1.659e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.649e-11■■■■■ 43.8
GTF2F1P35269 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.619e-11■■■■■ 43.8
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