Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tfap2aP34056 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tfap2aP34056 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tfap2aP34056 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tfap2aP34056 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms