Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LINC00032P0C843 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00032P0C843 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00032P0C843 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms