Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa1P09022 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxa1P09022 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa1P09022 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxa1P09022 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms