Protein–RNA interactions for Protein: P01896

H-2 class I histocompatibility antigen, alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01896 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01896 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01896 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01896 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01896 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01896 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01896 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01896 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01896 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01896 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01896 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01896 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01896 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01896 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01896 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01896 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01896 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01896 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01896 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01896 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01896 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01896 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01896 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01896 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01896 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01896 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01896 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01896 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01896 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01896 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01896 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01896 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01896 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01896 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01896 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01896 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01896 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01896 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01896 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01896 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01896 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01896 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01896 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01896 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01896 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01896 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01896 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01896 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01896 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01896 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01896 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01896 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01896 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01896 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01896 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01896 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01896 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01896 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01896 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01896 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01896 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01896 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01896 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01896 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01896 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01896 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01896 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01896 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01896 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01896 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01896 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01896 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01896 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01896 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01896 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01896 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01896 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01896 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01896 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01896 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01896 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01896 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01896 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01896 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01896 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01896 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01896 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01896 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01896 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01896 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01896 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01896 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01896 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01896 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01896 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01896 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01896 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01896 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01896 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01896 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms