Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nck2O55033 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nck2O55033 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nck2O55033 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nck2O55033 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Nck2O55033 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nck2O55033 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nck2O55033 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms