Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PrkcshO08795 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PrkcshO08795 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PrkcshO08795 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PrkcshO08795 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms