Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
U90926O08546 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
U90926O08546 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U90926O08546 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
U90926O08546 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
U90926O08546 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
U90926O08546 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U90926O08546 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U90926O08546 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
U90926O08546 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
U90926O08546 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U90926O08546 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U90926O08546 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U90926O08546 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U90926O08546 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
U90926O08546 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U90926O08546 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U90926O08546 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U90926O08546 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U90926O08546 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
U90926O08546 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U90926O08546 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U90926O08546 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U90926O08546 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U90926O08546 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U90926O08546 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U90926O08546 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U90926O08546 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U90926O08546 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U90926O08546 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U90926O08546 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U90926O08546 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U90926O08546 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U90926O08546 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U90926O08546 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U90926O08546 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U90926O08546 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U90926O08546 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U90926O08546 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U90926O08546 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U90926O08546 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U90926O08546 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U90926O08546 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U90926O08546 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U90926O08546 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
U90926O08546 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U90926O08546 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U90926O08546 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U90926O08546 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U90926O08546 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U90926O08546 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U90926O08546 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
U90926O08546 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
U90926O08546 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U90926O08546 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U90926O08546 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U90926O08546 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
U90926O08546 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
U90926O08546 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
U90926O08546 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U90926O08546 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U90926O08546 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
U90926O08546 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U90926O08546 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U90926O08546 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U90926O08546 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U90926O08546 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U90926O08546 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U90926O08546 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
U90926O08546 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U90926O08546 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U90926O08546 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
U90926O08546 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U90926O08546 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U90926O08546 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
U90926O08546 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
U90926O08546 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
U90926O08546 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
U90926O08546 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
U90926O08546 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
U90926O08546 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
U90926O08546 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
U90926O08546 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U90926O08546 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U90926O08546 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
U90926O08546 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
U90926O08546 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U90926O08546 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U90926O08546 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U90926O08546 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
U90926O08546 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
U90926O08546 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
U90926O08546 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U90926O08546 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U90926O08546 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
U90926O08546 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U90926O08546 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
U90926O08546 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
U90926O08546 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
U90926O08546 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 407.9 ms