Protein–RNA interactions for Protein: K9J7G9

Gm8677, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8677K9J7G9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm8677K9J7G9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8677K9J7G9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8677K9J7G9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms