Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPS5Q9UPZ3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234 ms