Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NDRG3Q9UGV2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NDRG3Q9UGV2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms