Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CCDC180Q9P1Z9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CCDC180Q9P1Z9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms