Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EHD3Q9NZN3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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