Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GOPCQ9HD26 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GOPCQ9HD26 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms