Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms