Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SPOCK3Q9BQ16 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SPOCK3Q9BQ16 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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