Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAPGEF4Q8WZA2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms