Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FGD3Q5JSP0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms