Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP2B2Q01814 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP2B2Q01814 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms