Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFTPCP11686 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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