Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIN3BO75182 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms