Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APAF1O14727 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APAF1O14727 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APAF1O14727 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APAF1O14727 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APAF1O14727 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APAF1O14727 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APAF1O14727 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APAF1O14727 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APAF1O14727 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
APAF1O14727 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APAF1O14727 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APAF1O14727 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms