Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TBCCD1Q9NVR7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TBCCD1Q9NVR7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms