Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ARFGAP3Q9NP61 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms