Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Higd1aQ9JLR9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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