Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDGFDQ9GZP0 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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