Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRXQ9BXM0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms